Τα κριτήρια για τη διάγνωση είναι να υπάρχουν μεταβολές στη μορφή των κοπράνων, πιο συχνή αφόδευση, αίμα στα κόπρανα, αίσθημα φουσκώματος ή έντονος κοιλιακός πόνος για μήνες. Δεν υπάρχει συγκεκριμένη εξέταση για τη διάγνωση του ευερέθιστου εντέρου. Ο γιατρός θα αποκλείσει άλλες παθήσεις που έχουν κάποια από τα συμπτώματα. Αιματολογικές εξετάσεις, κολονοσκόπηση και ακτινολογικές εξετάσεις είναι οι πρώτες εξετάσεις που θα σας κάνει ο γιατρός σας. Το ΣΕΕ (Σύνδρομο Ευερέθιστου Εντέρου) δεν απειλεί τη ζωή των ασθενών, κάνει όμως τη καθημερινότητά τους πιο δύσκολη, καθώς τα συμπτώματα μπορεί να επηρεάζουν και τις κοινωνικές τους δραστηριότητες.