Τα συμπτώματα διαφέρουν από άτομο σε άτομο. Πολλοί ασθενείς διαμαρτύρονται για έντονο πόνο στη περιοχή του κόκκυγα, πρήξιμο και φαγούρα. Όταν δημιουργηθεί απόστημα, λόγω εισχώρησης κάποιου μικροβίου, είναι πολύ εύκολο να το καταλάβει ο ασθενής, καθώς θα έχει δυσκολία στο κάθισμα ή το περπάτημα σε συνδυασμό με υψηλό πυρετό. Ακόμη, μπορεί κανείς να πει ότι πρόκειται για κύστη κόκκυγος όταν πύον με αίμα είναι εμφανές στη μεσογλουτιαία περιοχή. Κάποιες φορές δεν υπάρχουν συμπτώματα στη νόσο αυτή, με αποτέλεσμα να υπάρχει ίσως και για χρόνια μέχρι να το αντιληφθεί ο ασθενής.